Konoha es el hogar de algunos clanes poderosos y renombrados en este mundo, algunos de los cuales tienen un Técnica de línea sucesoria. Incluso los que no los poseen son igualmente formidables.

Clan Aburame : Miembros conocidos: Shino Aburame, Shibi Aburame
El Clan Aburame (油女一族, Aburame Ichizoku?) es quizá el más misterioso de todos en Konoha. Usan insectos como armas y espías. Estos, los kikaichu or kikai mushi, denominados bichos destructivos, se alimentan de chakra.

Los insectos viven en simbiosis con el cuerpo del ninja. Viven bajo su piel y se alimentan de su chakra. La relación es beneficiosa para ambos: los huéspedes proporcionan protección y alimento, convirtiéndose en colmenas, mientras que los insectos se convierten en siervos del humano, permitiéndole realiazar técnicas sin necesidad de sellos o de usar chakra. El bicho hembra puede ser puesto en un objetivo, puesto que su olor atrae a los machos; además, pueden ser usados como exploradores. Por ese motivo, este clan es experto en espionaje, (puesto que se puede comunicar con los insectos), y en sigilo.

Un rasgos definitorio de los miembros conocidos es que llevan gafas de sol siempre, y ropas que ocultan la totalidad de su cuerpo, incluso el cuello y la boca.

Aburame significa mujer del aceite, parecido a cucaracha (油虫, aburamushi?).

Clan Akimichi : Miembros conocidos: Chōji Akimichi, Chōza Akimichi
El Clan Akimichi (秋道一族, Akimichi Ichizoku?) es uno de los cuatro clanes nobles de Konoha. son capaces de convertir las calorías en chakra, que usan en su técnica particularpara aumentar en tamaño de partes de su cuerpo, y otras relacionadas.

Este clan tiene una relación especial con el clan Nara y el Clan Yamanaka. Durante al menos dos generaciones estos han formado un grupo "Ino-Shika-Cho", procedente de los nombres de sus integrantes. Los Akimichi son el Cho del trío.

Akimichi significa "el camino del otoño". "Aki" significa "otoño", que es tiempo de cosecha. "Michi" es la calle, que es donde se vende comida.
"Ino", "Shika" y "Cho" son los nombres de tres cartas necesarias para obtener una alta puntuación en el juego de cartas Hanafuda.

Clan Hyūga : Artículo principal: Clan Hyūga

Clan Inuzuka : Miembros conocidos: Kiba Inuzuka, Tsume Inuzuka, Hana Inuzuka
El Clan Inuzuka (犬塚家, Inuzuka ke?) es conocido por usar perros como compañeros en la lucha. Los miembros reciben uno o varios compañeros a determinada edad. Desde entonces, se vuelven inseparables. Los miembros de este clan tienen marcas rocas en las mejillas, ojos animales, y unos dientes más desarrollados.

El nombre "Inuzuka", significa "casa de perros", y era el nombre de una poderosa familia de la Prefectura de Chiba en Japón durante el Período Edo. Eran conocidos como "perros guerreros" y adoraban a Inu (perro), una deidad que representaba el símbolo zodiacal del perro. El nombre también está relacionado con Hakkenden, una novela sobre un perro samurai.
Los miembros conocidos reciben su nombre de una parte del cuerpo de un perro (nariz, garra, colmillo), y sus perros, de nombres de colores (rojo, gris, negro).

Clan Kurama : Miembros conocidos: Yakumo Kurama
El Clan Kurama era conocido por ser expertos en genjutsu, y aparece sólo en el anime. Una vez fue uno de los más activos y fuertes de Konoha. En la actualidad, están en decadencia. Sin embargo, apareció una chica, Yakumo, con gran destreza en las habilidades del clan. Ella creía que el tercer Hokage y Kurenai Yuhi planearon la muerte de su padre y el posterior sellado de sus poderes. Unkai, el más anciano del clan revela que la habilidad de esta chica es tan grande que puede hacer que el cerebro se crea la ilusión y provoque daño al cuerpo. Yakumo no podía controlar bien su poder y por ese motivo sus habilidades fueron selladas por el Hokage. Después se revela que dentro de la mente de Yakumo se encuentra el monstruo Idō.


Clan Nara : Miembros conocidos: Shikamaru Nara, Shikaku Nara, Yoshino Nara.
El clan Nara (奈良一族, Nara ichizoku?) es conocido por manipular las sombras y cuidar de los ciervos. Han mantenido y ampliado un gran libro con preparaciones y efectos de muchos medicamentos. En él están anotados los efectos de las píldoras que usa el Clan Akimichi. Los hombres de esta familia suelen ser muy perezosos y sienten atracción por mujeres mandonas.

El clan Nara tiene al menos un bosque al que sólo pueden acceder sus miembros, y que usa para recolectar componentes para medicinas. En este lugar es donde Shikamaru entierra vivo a Hidan, garantizándole así una eternidad bajo tierra, puesto que nadie más puede entrar allí con facilidad y desenterrarle, sin que lo sepan los de su clan.

Los Nara son los miembros Shika del trío "Ino-Shika-Cho".

El nombre proviene de la ciudad de Nara, en Japón, que es conocido por la abundancia de ciervos (Shika).

Clan Uchiha : Artículo principal: Clan Uchiha

Clan Yamanaka : Miembos conocidos: Ino Yamanaka, Inoichi Yamanaka
El Clan Yamanaka (山中家, Yamanaka ke?) posee una floristería y se especializa en manipular la mente de la gente. Los Yamanaka son los Ino del trío "Ino-Shika-Cho".

"Yamanaka" significa "en medio de la montaña".